Depois de mostrar às pessoas na E3 um novo nível de Sonic Generations, o produtor Takashi Lizuka destaca alguns dos conteúdos extra que só podem ser encontrados na versão 3DS. "Uma coisa importante a dizer sobre a versão do Nintendo 3DS é que além de Green Hill Zone, que é a zona de partida em todas as versões, todas as etapas da versão Nintendo 3DS serão diferentes dos estágios que são vistos na PS3 e 360" - Lizuka disse.
Sonic Generations irá revisitar e remixar níveis de toda a história do Sonic, incluindo a suas versões para Genesis e Dreamcast, mas só a versão 3DS pode conter partes a partir de fases de jogos portáteis mais antigos. "Para a PS3 e Xbox 360, nenhuma das etapas que estamos selecionando vão ser a partir dos portáteis", explicou Lizuka durante uma breve sessão de perguntas e respostas. "No entanto, no 3DS estamos escolhendo as fases de portáties também."
A versão portátil de Sonic Generations também vai oferecer uma fase especial, um modo versus e muita nostalgia para os fãs de Sonic.